浙江医药高专科学校药物化学研究所于2012年12月首批成立，目前研究所现有副教授5名，博士5人(其中海归博士后1名，在读博士2名)，硕士5人。主要研究方向：化学药物的合成及生产工艺研究；药物设计与合成和天然活性产物的结构修饰； 有机合成方法学研究等。近3年来先后承担各级各类课题11项，其中浙江省自然科学青年基金1项，宁波市自然科学基金5项，浙江省教育厅项目4项，浙江省重中之中项目1项。近3年来在国内外重要的学术期刊累计发表论文20余篇。承担的主干课程有药物化学、药物合成反应 、化工原理、药物分析、制药工艺学、药理学等。同时，研究所拥有一定的实验设备和科研环境，如微波反应器，旋蒸发仪，真空干燥箱，高压反应釜、超声波清洗机等常用实验仪器。与宁波市莨菪药物研究所、浙江日出实业集团公司、宁波大学及浙江工业大学重点实验室建立了长期的科研协作关系，公共实验平台各种仪器可共享。